Činnosť Základnej školy J. Horáka siaha do roku 1961, kedy došlo k jej slávnostnému otvoreniu. V tom čase 21 členný učiteľský zbor zabezpečoval vzdelávací proces pre 510 žiakov. V roku 1987 získala naša škola čestný názov Základná škola J. Horáka.

V roku 1993/94 sme dokončili vybavenie odborných učební zemepisu, hudobnej výchovy, prírodopisu, slovenského jazyka a učebne pre prácu s počítačmi za účelom kontinuálneho zvyšovania kvality výučby.

                Na základe predloženého projektu a dosiahnutých výsledkov získala naša škola 1.2.1995 Certifikát o prijatí do Národnej siete Škôl podporujúcich zdravie v Slovenskej republike.

V školskom roku 2004 / 2005 sme sa zapojili do pilotného ročníka projektu „Zelená škola“, kde sme získali titul „Zelenej školy“ na nasledujúci školský rok. Každoročne úspešne bojujeme o priznanie tohto titulu.

V súčasnosti pôsobí Základná škola J. Horáka na Ul. P. Dobšinského 17, 969 22 Banská Štiavnica,  v zriaďovateľskej kompetencii mesta Banská Štiavnica.